Die Priorität des Programms INTERREG V-A Österreich-Tschechische Republik besteht in der ökonomischen Entwicklung des Programmgebiets, mit Rücksicht auf innovative Lösungen und Unterstützung der grenzüberschreitenden Zusammenarbeit.
Anhand der identifizierten Bedarfe im Programmgebiet wurden die folgenden thematischen Ziele festgestellt, die im Programm unterstützt werden.